影响西瓜瓤色的因素，即影响细胞色素形成的因素，主要有以下几点：
1、温度。色素的形成与温度有关。同一品种在不同季节栽培，由于果实发育期所处的温度不同，瓜瓤的深浅有一定差别。另外，果实的向阳面较着地面（阴面）着色较好，这是因为果实阳面的温度高于阴面之故。红瓤西瓜品种，其果肉颜色受茄红素的含量所支配。在秋季栽培条件下，因为西瓜变瓤期瓜气温较低，影响红瓤品种中所含茄红素的形成，致使瓤红色变淡。
2、栽培管理条件。在西瓜生长过程中，施肥、浇水不适时，或施肥过程中偏施氮肥等，都可能造成色素形成受阻。
3、留瓜节位。留瓜节位过低，此时功能叶较少，造成果实发育不良，果实空心或着纤维增多；留瓜节位过高，由于光合效率降低，呼吸消耗增加，果实含糖量降低，果肉变软着色不良。此外，授粉受精不良，不能形成种子，没有形成种子的部位胎座发育不良，质地较硬，着色不佳，品质低劣。
