棉花苗期虫害有苗蚜、地老虎、金针虫、红蜘蛛等，棉花出苗应严密监测，达到防治指标时，及时喷药防治，以确保棉苗正常生长。
一、苗蚜：当百株蚜量1000头、卷叶株率为5％时，可选用40％的氧化乐果100倍液、20％的灭多威250倍液滴心；也可用10%吡虫啉可湿性粉剂1000倍液或3%啶虫脒乳油1500倍液喷雾。
二、地老虎：防治3龄前地老虎，可撒毒土。每亩用5％的毒死蜱颗粒剂3公斤，加适量细沙土混合均匀，或每亩用48％的乐斯本乳油300毫升，加细沙土20公斤混合均匀，于傍晚顺垄撒施。如地老虎超过3龄，要用敌百虫毒饵防治。用90％的晶体敌百虫100克，加水1公斤，拌10公斤麦麸或棉子饼，于傍晚顺垄撒施，每亩撒2～3公斤，防效在80％以上。
三、金针虫：用48%乐斯本350毫升/亩灌根可有效防治金针虫；灌根的方法：用喷雾器把喷头拧去，对着棉苗根部喷灌。用药量以达到灌透根部为止。
四、红蜘蛛：主要在棉叶反面为害形成黄白色小点，当百株螨量200头时，可选用10%哒螨灵2000--3000倍液喷雾防治。