袋栽菇的品质好坏，关键在于发菌期的病害防治。因此，要提高袋栽菇产量，发菌期应采取以下6项措施。
1、优选原辅材料制种用的材料如棉籽壳、玉米芯、木屑、麸皮、米糠及石膏、碳酸钙等，应新鲜、干燥、无霉变、营养成分不掺假。使用前阳光曝晒1～2天，利用紫外线杀死其中的病原孢子。
2、合理采用料基米糠和麸皮不仅是菌丝发育很好的氮源，同时又是碳源，其用量应随环境相对湿度的变化而适当增减。用量过大易被杂菌利用而造成污染。因此，要适当控制其含量在18％～25％，高湿季节要减至18％。
3、调控料水比例食用菌生长发育所需的水分绝大部分来自培养料，不同的栽培季节使用不同的装料容器以及封口材料，料水比也不相同。过干菌丝生长量少，而且纤弱；过湿会引起菌丝腐烂及病害发生。
4、堵塞侵菌孔口瓶子或袋子一定要扎好口，扎口不严很易导致杂菌的入侵。
5、防止培养料变质培养料配好后应及时装袋和灭菌，不然容易发酸变质。灭菌要彻底。无论是制作菌种还是熟料栽培，灭菌不严常导致病害的发生。
6、加强发菌期管理①适当降温培养。大多数病菌是喜高温的，除草菇外可适当降温培养，这样虽然菌丝生长速度较慢，但粗壮有力，而病原菌明显减少。尤其是生料栽培培养温度要在20℃以下。②降湿培养。食用菌在菌丝体生长期要求空气相对湿度一般比病原菌低，因此，在发菌期空气相对湿度应保持在60％左右，有效抑制病菌的发生。③及时翻堆检查。接种2～3天后进行第一次翻堆检查，发现受病原菌侵染的要及时捡出来。
