棉花是需肥较多的作物，尤其抗虫棉需肥更多，必须做到科学施肥才能高产。必须针对抗虫棉的生育特点，改进常规施肥技术，做到科学施肥：合理施足基肥，重视钾肥使用，早施提苗肥，稳施蕾肥，重施花铃肥，补施盖顶肥。
合理施足基肥:抗虫棉要获得高产，必须合理施足基肥。基肥要以农家肥为主，大幅减少氮肥用量，由目前亩施尿素25公斤、或碳酸氢铵50公斤，减至尿素12公斤、或碳酸氢铵25公斤；亩施过磷酸钙由50公斤，减至25公斤；棉花是喜钾作物，亩施钾肥10-20公斤。将上述肥料结合整地，深施15厘米以下。
早施提苗肥:多数抗虫棉品种的种皮较厚，发芽出苗慢，苗期长势较弱。加之春季气温低，低温和晚霜时常发生，严重影响棉苗生长。为了促苗健壮生长，适当早施提苗肥，由非抗虫棉的4-5叶期追施，提早到3-4片叶追施。亩追磷酸二铵5-6公斤，施在距苗10厘米、深10厘米处，随施肥随覆土，防止肥料流失、损伤棉苗。施肥与浇水配合，做到以水促肥。北方棉区，棉花苗期十年九旱，采用化肥对水穴施方法良好。
稳施蕾肥:蕾期是棉花由营养生长转入了营养生长与生殖生长并进时期，所需肥料比苗期大幅增加。但这时的气温较高，棉苗的根系比较发达，吸收力增强，若氮肥使用过多，易发生徒长，导致花蕾大量脱落，所以蕾肥要稳施。抗虫棉现蕾多而快，花蕾脱落少，需肥量比非抗虫棉多，肥料供应不足，会抑制营养生长，影响结铃和搭丰产架子。提苗肥宜在现蕾初期追施，亩施尿素5-8公斤；基肥施钾不足的，应加施5-8公斤钾肥。肥料要施在距苗20厘米、地表10厘米以下，并做好覆土，防止肥料流失。
重施花铃肥:花铃期是棉花一生中生长发育最旺盛，需肥最多的时期，也是决定产量高低的关键时期。抗虫棉开花结铃快而集中，需肥量上升迅猛，需肥高峰期提前，如果施肥跟不上，极易引起早衰。但花铃期正处高温多雨季节，如果一次施肥过多，极易引起棉花徒长，造成蕾铃大量脱落。因此，为了满足棉株不断开花结铃的需求，花铃肥宜分两次追施，用量比非抗虫棉适当增加。初花期追施钾肥效果显著。
补施盖顶肥:棉株后期根系活力减弱，吸收能力下降，易发红叶茎枯病而引起早衰。及时追施盖顶肥，是预防早衰的有效措施。采用叶面施肥，简便易行，见效快，省肥料，效果好。笔者试验，每亩每次喷施0.3%磷酸二氢钾溶液50公斤，7天一次，喷施3次的，增产5.6%，亩增收46元。从8月中旬开始，喷施0.3%磷酸二氢钾溶液，或1%尿素与2%过磷酸钙混合液，每周一次，连喷3次。
