嫁接的成活率受砧木与接穗的亲合力、嫁接技术、嫁接后的管理等因素的影响。而砧木与接穗的亲合力高低是基本的因素。它不仅影响嫁接的成活率，还会进一步影响黄瓜的产量和品质。所以要特别注意砧木与接穗的正确选择。
嫁接的砧木应具备与黄瓜亲合力强，生长旺盛，生长期长，耐低温、高温、和贫瘠能力强，根系吸收能力强，耐湿、耐旱，抗黄瓜的主要病害，特别是枯萎病等土传病害。秋、冬、春嫁接栽培宜选择耐低温和高温的品种作砧木，以适于秋、冬、春季栽培的黄瓜品种作接穗；而夏季宜选用耐高温的黄瓜品种作接穗。我国目前冬、春季栽培黄瓜嫁接砧木主要用美国黑籽南瓜、南砧1号(即云南黑籽南瓜)、汲87～1、汲87～2等，其中用普遍的是云南黑籽南瓜。夏秋季栽培用的砧木除抗病外，还要耐热，砧木可选用日本的金刚、刚力、改良新土佐1号、云龙1号等。
嫁接后接穗的生长习性、抗逆性、抗病性、商品性等仍以原有特性为主表现出来。所以接穗(黄瓜)品种的选择要根据栽培的季节和当地的消费习惯，选择抗逆和抗病性强、丰产、优质，与砧木亲合力强的品种。特别要注意不是所有的黄瓜品种都能与上述的砧木嫁接生产的，如用耐低温的云南黑籽南瓜与耐高温的夏丰黄瓜品种嫁接，一般成活率较低。冬茬日光温室黄瓜接穗宜选用耐低温、耐弱光，植株长势旺，不易徒长，雌花节位低，节成性好，抗病，品质好的密刺类型。
