1低温与高温危害
薄皮甜瓜不耐低温。当保护地内气温为0～1℃时，经数小时就会死亡；当温度降至冰点以下时，冰凌会使薄皮甜瓜瓜秧体内细胞及组织造成机械损伤，致使细胞失水死亡；0～10℃时，低温会减弱光合作用，消耗大量的营养物质。薄皮甜瓜对高温反应敏感。气温长时间持续30℃时，植株明显徒长，叶片易老化，果实色泽差、易发软；35℃以上时，呼吸作用过强，大量消耗瓜秧植株体内营养，净同化率为负值；气温达45℃并保持约3h时，茎叶受损，叶色变淡，叶缘枯黄，雄花落蕾或不能开花，花粉发芽力低下；高温达50℃时，薄皮甜瓜的茎叶会在短时间内死亡。在防治上，育苗期进行8h短日照及低夜温处理，即白天维持温度在25℃左右，夜间14～15℃，以促进雌花的分化、发育。结瓜期，昼温控制在25～28℃，夜温13～15℃，昼夜温差以10℃左右为宜。
2植株营养不良
①缺氮。
下位叶至上位叶逐渐变黄，初发病时叶脉间变黄，叶脉凸出可见，最后叶变黄；植株纤细、矮小、花蕾黄落。
②缺磷。
苗期叶色浓绿、硬化、矮化，叶片小稍微向上挺，严重时，下位叶产生不规则褪绿斑；株型瘦弱，果实品质变劣。
③缺钾。
甜瓜生长前期叶缘出现轻微的黄化，然后是叶脉间黄化。
④缺镁。
上位叶表现异常，叶脉间渐渐由绿变黄，严重缺镁时，除叶缘残留少量绿色外，叶缘间均黄化。
⑤缺铁。
植株的新叶除了叶脉全部黄化，叶脉逐渐失绿，采用营养液培育的幼苗可见上部叶片出现黄化现象。
在防治上：
①缺氮。基施腐熟有机肥75t/hm2，追施尿素等氮肥；根外追肥，可喷洒0.1%～0.2%尿素溶液，隔7～10d喷1次。
②缺磷。多施用腐熟的禽粪、磷酸二铵、过磷酸钙等磷肥；叶面喷洒0.1%～0.2%磷酸二氢钾溶液。
③缺钾。施用足量的腐熟有机肥，同时配施适量的硫酸钾或草木灰；叶面喷洒0.1%～0.2%硫酸钾溶液或同等浓度的磷酸氢二钾溶液。
④缺镁。多施用腐熟有机肥；叶面喷洒0.1%～0.2%硫酸镁溶液。
⑤缺铁。足量的基肥在整地时翻、混入耕层，配施适量的硫酸亚铁；叶面喷洒0.1%～0.2%硫酸亚铁溶液。
3秧苗徒长
徒长苗抗性差，易发生病害和冻害，花芽分化不正常，易化瓜。定植后缓苗慢，成活率低，成株期植株生长旺盛但很少结瓜。在防治上，降低温度，维持白天温度在25℃，夜间15℃；增强光照；及时间苗、分苗，扩大行株距；控制徒长，可喷洒50mg/kg多效唑等生长抑制剂；适当浇水。
4秧苗僵化
秧苗僵化表现为苗矮小、茎细、叶小、根系少，花芽分化不正常，定植后缓苗慢。主要是由过分控制肥水、温度偏低、喷乙烯利浓度过高或喷洒量过大造成的。在防治上，应采取适宜的水肥管理措施，加强保温，合理调控植株生长。
5烧根
烧根主要是由育苗期施用肥料过多，土壤溶液浓度过高造成的。在防治上，甜瓜套袋注意做好两点应适量施肥，遵循少量多次的原则，施氮肥150kg/hm2，施肥后及时浇水，以降低土壤溶液浓度。
6沤根
沤根主要由土壤湿度过大、缺少空气，加上地温低造成的。在防治上，应控制浇水，加强通风，适当松土，提高地温。
7秧苗风干和日照萎蔫
主要是由蒸腾作用突然加强，破坏了原来的平衡，细胞组织失水得不到补充造成的。在防治上，通风时应遵循由小到大的原则，或进行短期遮光处理。
8化瓜
主要是由叶片同化功能下降，植株营养不良造成的。改变传统陋习甜瓜获高产另外，雌花多，坐瓜多，易化瓜。在防治上，选用结实强的品种；施足底肥，适期追肥，促进同化作用；夜间适宜降低温度，降低呼吸消耗；降低密度，增加光照。
9氨气危害
一般氨气气体浓度达到10mg/kg时就有危害症状发生。主要是危害叶缘，先使组织变色、叶缘呈灼伤状，变为黄白或淡褐色，以致叶片枯死。氨气在保护地栽培中主要来源于有机肥料的分解，特别是未腐熟有机肥料的分解和氨态氮肥的气化。施用未腐熟的有机肥和尿素等肥料、一次施用氮素化肥过多，使局部土壤变成碱性，均可引起氨的危害。在防治上，应施用充分腐熟的有机肥；氮素化肥一次要少施、深施；适当多浇水，抑制氨的挥发；施肥后加强通风。
