一般情况下，草菇播种后12小时左右菌种块就开始萌发，并不断向料内生长。如果播种后24小时菌丝仍未萌发或仍不向料内生长，就可能是发生了菌丝萎缩。
菌丝萎缩的原因：
①高温烧菌。当培养料内的温度长时间超过45℃时，就会使菌丝萎缩死亡。
②药物影响。草菇对农药十分敏感，播种后，有的菇农为了防病杀虫会喷洒农药，致使菌丝因药害而萎缩。
③缺氧窒息。培养料含水量过高（超过70%）或塑料薄膜覆盖过严，使草菇菌丝因缺氧窒息而萎缩。
④氨气危害。培养料内的尿素添加过量或田内化肥含量过高，挥发出来的氨气散发不了，对草菇菌丝造成危害。
⑤菌种低劣。菌种的菌龄太短或太长，生活力弱，抗逆性差，在环境条件不适宜的情况下发生萎缩。
⑥温差过大。草菇的菌丝对温差较敏感，如白天气温在32℃以上，夜间温度在28℃以下，喷水后即会发生菌丝萎缩。
⑦发生虫害。培养料中出现害虫，由于害虫的咬食，致使菌丝萎缩。
