西瓜育苗时，提前配备必要的保温、增温设施。针对北方冬季寒冷的实际，要在育苗前提早准备想办法改善育苗棚的保温、增温设施。有条件尽可能选用无滴膜，有利于改善光照条件，甚至能提高棚温1-2度;为给棚内增温，应配备一定的火墙或加热炉等临时加热设备。
采取措施适当提高苗子的抗寒能力。通过对育苗的西瓜和砧木种子进行低温处理，可适当增强幼苗的抗寒力。具体方法是：把浸种后将要催芽的种子，放在0℃左右的冷冻环境中24小时，然后置于适温条件下催芽，当种子露白时，每天在零下1℃的环境条件下处理12-18小时。然后逐步转到18℃的环境条件下处理12-6小时，共处理3-5天，再将各方种子在适温条件下催芽即可。
在西瓜育苗期间遇到灾害性天气的管理。在冬季西瓜育苗期间，容易出现的灾害性天气主要有，连阴雨(雪)、强寒流等恶劣天气，在此期间的管理也是育苗成败的重要环节。需注意收听天气预报，在寒流到来之前采取保温增温措施。在雨雪来临时必须在草苫上盖二层薄膜。连阴雨(雪)天时，在不产生冻害的前提下尽可能增加光照。若揭苫后床温下降，就应揭开草苫，下午3时前盖上。若床温略有下降，可随揭随盖。切勿几日不揭苫，有雨(雪)时要在雨(雪)暂停间隙随揭随盖草苫，长时间光照不足，可用日光灯进行人工补光。久阴乍晴后揭苫要缓慢进行，否则易造成闪苗甚至倒苗若发现幼苗有萎焉现象，应随即覆盖遮荫，等瓜苗恢复正常后再揭。如此反复几次，直到不萎焉为止。再把草苫全部揭开，之后进入正常管理。
西瓜苗子定植前如何管理。一般在定植前7-10天，要适当逐渐加大通风量，利用降温的方式进行炼苗，以适应栽培的大环境，在白天要保证15-20℃，在瓜苗不受冻害的限度内，尽量降低夜间温度，可降到8-10℃，使瓜苗适应定植后的环境条件。
西瓜嫁接后前一周的管理。西瓜嫁接后前一周的管理比较重要，嫁接后一周内是伤口愈合的关键，此时一定要保持棚温在20-30℃范围内。夜间当温度降到18℃之前，要立即启动人工增温设施，做好随时进行增温的准备，当真正温度降到18℃时要立即进行人工增温。嫁接苗床3-6天应严格密封，保持床内相对温度100%，前3天要完全遮荫，只能透过微弱的散射光，第4天逐渐见光，6天后逐渐通风，第7天后撤掉遮阴物和加大通风量。使嫁接苗适应正常苗床环境。