草莓是难储存的水果，最好随采随销，临时运输有困难的，可将包装好的草莓放入通气凉爽的库房内，包装箱摆放在货架上，不要就地堆放。由于草莓极不耐储存，即使存放3～5天，果实的失水、腐烂现象也很严重。草莓采后腐烂的主要原因是灰霉所致。灰霉病的病原菌多数是由田间带来的。采收的果实感染病菌后，即使在5℃条件下，1周之内就可见到腐烂的病斑，为了使果实采收后储存和运输中保持其新鲜度和品质，仍需要采取适宜的储藏方法。
一、低温储藏
研究表明，储运草莓的最适温度是0～0.5℃，允许最高温度是4.4℃，但持续时间不能超过48小时。同时空气湿度保持在80%～90%，草莓采收后，要快速而均匀地预冷，然后低温储藏。库温保持0～2℃恒温，可存放7～10天，但冷藏时间不能过长，否则风味品质会逐渐下降。如果冷库温度在12℃左右，可储藏3天，在8℃以上能储放4天。无公害草莓储藏要求不超过5天。
二、气调储存
气调储存是在草莓储存过程中，人为调节空气的组成，以达到储存保鲜的目的。目前，多采用塑料薄膜帐储存，即利用厚0.2毫米的聚乙烯膜做帐，形成一个相对密封的储存环境，加上硅窗控制。草莓气调的适宜气体成分是：3%氧气，3%～6%二氧化碳，91%～94%氮气，储藏时间是10～15天，如将气调与低温冷藏相结合，储存期会更长。二氧化碳浓度要适当控制，如果高到10%时，果实软化，风味差，并带有酒味。
美国加利福尼亚州用光钝感型草莓品种芳香、钻石和赛尔娃进行了高二氧化碳条件下储藏试验，结果表明，提高二氧化碳浓度储存的草莓果香味有增加的趋势，高二氧化碳气体有刺激草莓果发酵的作用，乙醇浓度升高有利于乙酸乙酯的合成，提高了草莓芳香物质的总量。
据国内试验，宝交早生草莓密封在真空干燥器内，充入钢瓶二氧化碳，浓度10%，在0℃下储藏20天的好果率和商品率达到94%，这为草莓运输和短期储藏开辟了新的途径。
三、辐射储藏
辐射储藏是利用同位素钴60放出的γ-射线辐射草莓浆果，杀伤果实表面所有的微生物，以减少各种病害的感染，达到储藏保鲜的目的。用2000戈（1戈=1焦耳/千克）剂量照射草莓可显著降低果实霉菌的数量，约减少90%，同时还消灭了其他革兰阴性杆菌。
四、热处理储藏
草莓热处理是防止果实采后腐烂的一种有效的、安全的、简单的、经济的方法。在空气湿度较高的情况下，草莓果实在44摄氏度下处理40～60分钟，可以使草莓腐烂率减少50%，处理40分钟时，浆果的风味、香味、质地和外观品质不受影响。
五、离子电渗储藏
将草莓放入电渗槽的电渗液（1%氯化钙加0.2%亚硫酸钠）中，用110伏电压、50毫安电流进行电渗处理1.5小时捞出，用水冲洗，沥干后装入聚乙烯膜袋中封口，在4℃低温储藏，相对湿度为92%～95%。电渗后使果实中钙浓度增加，可稳定生物膜的结构，降低通透性，防止组织崩解。亚硫酸钠分解产生二氧化碳，不仅有防腐作用，还可抑制果实中多酚氧化酶的活性，可抑制果实褐变，经离子电渗法处理的草莓，储藏30天的腐果率低于5%，浆果品质也保持较好。
六、脱乙酰甲壳素涂膜
脱乙酰甲壳素是一种高分子量的阳离子多糖，能形成半渗透性膜，而且无毒安全。用1%的脱乙酰甲壳素在草莓果上涂一层膜，在13℃条件下能明显减少草莓的腐烂，21天后，腐烂率约为对照的1/5，效果好于杀菌剂，且无伤害，能保持较好的硬度。
