1、水稻抽穗期遇阴雨是稻曲病流行的重要原因。
阴雨有利于病菌孢子的萌发，破口抽穗至齐穗期遇连绵阴雨诱发病害流行。据调查，病情轻重与遇雨天数成正相关，二天以下时，病情轻微。
2、水稻抽穗期遇较低的温度是病害流行的主要原因。
稻曲病菌侵入为害，适温或较低温度有利，高温不利；日平均温度低于25℃，极端低温低于23℃，且持续时间超过二天以上，最低极端温度在20℃以下时，病情严重，反之，随着温度的升高，病情减轻。低温除导致水稻本身抗逆能力降低有利发病外，亦导致颖壳的开张时间拉长，有利于病菌的侵入。据观察，在30℃时，颖壳开张时间一般为2-3小时，23℃时，颖壳开张时间一般为5-6小时，大大拉长了颖壳开张时间，加速了病菌的侵入。
3、过量施用氮肥，偏施氮肥加重了病情。
过量施用氮肥、且未施磷钾肥、禾苗贪青的田，病情最重；氮肥适当、未施磷钾肥的田，病情次之，但仍较重；氮磷钾适当，禾苗生长正常的田，病情轻微。过量施用氮肥、偏施氮肥加重了病情，而氮磷钾搭配施用，对病害的流行有显著的控制作用。
4、破口抽穗期未用药防治使病菌长驱直入。
调查中发现，同一品种，同为4月24日播种，施肥及禾苗生长相近，一丘在破口期、齐穗期各施用一次杀菌剂，病指为1.2；另一丘未施药防治，病指为37.8。破口抽穗期施药防治对病害有明显的控制作用，而未施药防治的，使病菌长驱直入，加速流行。
5、品种（组合）间的抗性也有一定的差异。
不同品种（组合）抗病性有一定差异，但不明显。同一品种有未发病的、有病情轻微的、有病情严重的，但主要原因还是前述的几种。
