1.生态调控
（1）合理轮作
实行水旱轮作。
（2）清洁田园
清除藕塘边杂草，清理田内浮萍，将病株及残败枝叶彻底深埋或烧毁，杜绝传染源。
（3）土壤消毒
栽藕前20～30天在田间全面均匀撒生石灰100～150千克每666.7平方米，然后均匀地翻入土层中，起到杀菌消毒的作用。同时合理施用磷酸二氢钾、硼、锌等微肥，增强莲藕的抗病能力。
（4）健身栽培
①选择抗病品种。因地制宜，选择高产、抗病或耐病品种。
②选择抗病种苗。从无病藕田选择整齐、健壮、无损伤的莲藕作种苗。
③藕种茎消毒。用99%噁霉灵粉剂3500～4000倍液对藕种浸泡3小时消毒或用2.5%咯菌腈悬浮剂100毫升兑水处理100千克藕种茎。
④合理施肥。施肥以底施腐熟的农家肥为主，每公顷施农家肥30000～45000千克或腐熟人粪尿30000千克、过磷酸钙600～750千克、尿素150～225千克、硫酸钾105～150千克，有条件的增施草木灰1500～3000千克。
⑤藕土处理。栽植前每666.7平方米使用＞5亿/g枯草芽孢杆菌+胶冻类芽孢杆菌菌剂40千克改良土壤生态。
（5）科学管理
①避免混栽。在莲藕生产中，尽力成片种植，避免春夏两茬混栽，减少桥梁田，切断病菌传播途径。
②科学用水。夏季高温时，应深灌水或采用流水灌溉，按莲藕不同生育阶段需要管好水层，做到深浅适宜，以水调温，防止因水温过高或长期深灌加重发病。生长期间及留种田，冬季都不要断水，切勿排干水和冬翻晒垡。
③转藕头。为了使莲藕在田间均匀生长或防止莲鞭穿越田埂，应随时将生长较密地方的莲鞭移植到较稀处，也应随时将田埂周围的莲鞭转向田内生长。莲鞭较嫩，操作时应特别小心，以免折断。
④折花打莲蓬。藕莲的多数品种都开花结实。在其生长期内可将其摘除，以利营养向地下部位转移，也可防止莲子老熟后落入田内发芽造成生物学混杂。
（6）免疫诱抗
立叶长整齐后，每隔10天左右，喷一次5%氨基寡糖素1000倍液，共喷2～3遍。
2.生物防治
（1）保护天敌
害虫的危害及活动会给莲藕造成伤害或形成小的伤口，从而增加病菌侵染的机会，造成病害的传播蔓延。保护青蛙、蜻蜓、蜘蛛、异色瓢虫、中华草蛉、食蚜盲蝽、蚜茧蜂等天敌，可以减少害虫的数量，从而杜绝或减少莲藕腐病的发病几率。
（2）建立人工食物链
利用藕田养鸭、养鱼控虫除草，控制莲藕基部病虫草的危害。
（3）生物农药
病害早期用100亿/mL多粘类芽孢杆菌300～500倍液喷雾防治。
3.科学用药
加强病虫测报，适时用药，未达到防治指标时不要用药。使用的农药每种每年最多使用2次。成虫发生期，要统一防治。农药要交替、混合使用，延缓抗药性。
（1）莲藕莲种植田病害防治
当立叶长整齐后，将田中水控制在2～3厘米后，结合撒施有机肥加撒99%噁霉灵杀菌剂；发病严重的藕田在立叶封垄后，再结合施肥伴撒施99%噁霉灵2～3次。
（2）子莲种植田病害防治
田间进行打藕枝促发枝时，用99%噁霉灵粉剂3000倍液灌蔸，以防止病原菌从伤口侵入；当莲株长出第二片立叶时，结合施立叶肥，在肥料中加撒99%噁霉灵杀菌剂。
（3）喷雾防治法
发现病株后及时拔出，并喷洒25%丙环唑乳油1500～2000倍液或68%精甲霜·锰锌水分散粒剂800～1000倍液或50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂350～600倍液，每7～10天喷洒一次，连续喷2～3次。同时在药液在加入少量洗衣粉或有机硅，以增强药液的附着力，增加施药效果。
（4）注射防治法
用25%丙环唑乳油，正常使用商品量为24毫升每666.7平方米，施药按1:80的兑水量配成2千克注射药液，每根叶柄注射4毫升。注射器用医用的，针头用兽用的，注3～4次。
