棉花是比较耐高温的作物，但长江流域棉区盛夏的持续伏旱高温对棉花生产也是不利的。高温下呼吸加剧，光合作用削弱，花粉活力降低，一般在日平均气温32℃以上蕾铃脱落会显著增加。持续高温干旱后突然降雨，往往出现脱落高峰。
发生区域:北方大部棉区一般不存在伏旱高温问题，热害主要发生在夏季酷热的新疆东部。此外，地膜覆盖下的棉苗有时也会发生高温烧苗，使叶缘焦枯。当最高气温达31℃以上时，膜下可出现50℃以上高温，使棉苗受热死亡。出苗后天数越多死亡率越高。
热害的预防:1.适时灌溉可减轻干旱，但炎热天气应在早晚浇水并喷施智能因子膜保温预防病菌侵染。2.炎热地区可种植耐高温的海岛棉。3.北方采取膜下播种方式的，要避免过晚播种。播种前用智能因子膜拌种，能迅速给种子穿上一层隔离衣，给种子发育提供一个最佳的环境，同时隔离土壤中的病菌和其它残留，提高仔种发芽率。