采收后的火龙果果实属于呼吸率低的水果，并且由于果皮厚又有蜡质保护，极耐贮运。在5～9℃的低温中，新鲜摘下的火龙果不经挤压碰撞，保存期可超过一个月；在25～30℃的室温状态下，保质期可超过2个星期。
在常温下可保存15天以上，若装箱冷藏，贮藏温度在15℃左右，保存时间更可长达一个月以上。但在高温季节，火龙果收获后必须置于阴凉处晾凉散热，并进行冷藏以利于保鲜。
火龙果是热带水果，最好现买现吃，有朋友习惯将切开后吃剩的一半火龙果放在冰箱里储藏，其实这种保存方法是不科学的。由于长期生长在热带、亚热带地区，受生长气候条件影响，火龙果害怕低温，放在冰箱里之后容易被冻伤，果皮会发生凹陷，出现一些黑褐色的斑点。不仅营养成分遭到破坏，还很容易变质，再过几天，果肉的颜色就会变成褐色，并开始腐烂。
因此，像火龙果等热带水果最好放在避光、阴凉的地方贮藏，如果一定要放入冰箱，应置于温度较高的蔬果槽中，保存的时间最好不要超过两天。从冰箱取出后，在正常温度下会加速变质，所以要尽早食用。
对于较为成熟的火龙果，买回来之后最好放在阴凉避光的地方，反之，则可放在室温下催熟。
