南瓜应以农家肥或有机肥为主，施足底肥，禁用含氯肥料。南瓜生长中的主要施肥有地下追肥、冲施肥和根外施肥等。南瓜生长期应该多施农家肥，并保证水分供应，防治病虫害。每公顷施腐熟优质有机肥75000千克，在翻二犁前撒施或在播种畦内集中施入。如果苗势较弱，叶色淡而发黄，可结合浇水追施发棵肥，每公顷追施稀粪水3750-4500千克。当植株进入生长中期，坐住1-2个幼瓜时，应在封行前重施催果肥，一般每公顷追施腐熟的稀粪水或饼肥水15000-22500千克。此期若干旱，可结合浇水，可随水冲施复合肥225-300千克/公顷。在果实开始采收后，为防植株早衰，增加后期产量，还可追施少量有机肥。如果不收嫩瓜，而准备以收成熟瓜为主，后期不必追肥，只需要浇水或排涝。中后期也可喷施0.2%-0.3%的磷酸二氢钾，7-10天1次，连喷2-3次。
